Base de datos sobre mosca de fruta pequeña

Base de datos sobre mosca de fruta pequeña

Durante más de un siglo, Humble Fruit Fly ha llevado a muchos avances científicos críticos.

Este pequeño insecto ayudó a los investigadores a descubrir que los rayos x pueden conducir a mutaciones genéticas. Esos genes pasan de los padres al niño a través de los cromosomas. Un gen conocido como período ayuda a nuestros cuerpos a mantener el tiempo, y las barreras para ese reloj interno pueden causar retraso y representar un mayor riesgo para las enfermedades neurológicas y metabólicas.

Esos inventos son parte de la principal base de datos en línea, Flybase, con aproximadamente otros 90,000 estudios, e investigadores utilizados habitualmente para diseñar rápidamente nuevos experimentos. Estas pruebas exploran las causas raíz de la enfermedad y ayudan al desarrollo de nuevos tratamientos. La ciencia construye ideas anteriores, y el repositorio apropiado de progresos pasados ​​sirve como encendido para futuros inventos.

El sitio web recibe alrededor de 770,000 visitas de páginas cada mes de científicos que trabajan en todo el mundo en la formación de candidatos a drogas para afecciones como enfermedades neurogenerativas humanas, y los medicamentos para los cánceres raros.

Ahora, ese recurso crítico está al borde del despido que representan un riesgo para la capacidad de hacer que su futuro e investigación sean más efectivos.

Esta primavera, La administración Trump canceló una subvención utilizada para gestionar Flybase como parte de sus amplios recortes de fondos de 2 2.200 millones de fondos en la Universidad de Harvard.

«Utilizo Flybase todos los días. Esto es muy necesario», dijo Celest Berg, profesor de la Universidad de Washington, dijo que no es parte de un equipo que administra la Flybase. «Sabemos lo que sabemos sobre los genes humanos y cómo funcionan proviene de sistemas modelo como Drosophila».

Los humanos comparten nuestros 60% de los genes con moscas de la fruta, también conocidas por su nombre científico Drosophila melanogaster.

El ahora futuro de Flybase encabeza cómo interferir con los esfuerzos de investigación interconectados e interdependientes y los efectos de los fondos para una organización fluctúa en todo el mundo. Más de 4,000 laboratorios usan Flybase.

Harvard estaba recibiendo un millón de 2 millones de fondos federales al año para administrar la cadena de flys, la mayor parte del presupuesto operativo total del sitio web. Pero la Universidad de Nuevo México, la Universidad de Indiana y la Universidad de Cambridge en Inglaterra son un socio que ayuda a administrar la Flybase de Harvard y también los beneficiarios.

«No afecta a Harvard», dijo Brian Calvi, profesor de biología en la Universidad de Indiana, parte del equipo de gestión de Flybase. «El efecto de la fluctuación es para la comunidad internacional de investigación biomédica».

El Departamento de Arte y Ciencias de Harvard protegió la Flybase de los fondos intermedios, pero ese apoyo se detiene en octubre, dijo Norbert Periman, profesor de la Facultad de Medicina de Harvard.

A principios de este mes, el juez ordenó la restauración de los investigadores de Harvard que perdieron la subvención ante la administración Trump, pero el dinero no había comenzado a fluir hacia el flybace, dijo Periman. La administración ha prometido apelar la decisión, lo que puede evitar el flujo de fondos.

La Casa Blanca no respondió a la solicitud de la respuesta. El Departamento de Salud y Servicios Humanos de EE. UU. Se negó a responder a la supervisión de las agencias nacionales de salud.

El sitio de noticias neurológicas, el transmisor, informó por primera vez el despido de la cadena. Harvard Crimson informa sobre el Departamento de Artes y Ciencias, sobre la decisión de no continuar con el fondo interino.

Calvi dijo que la beca Flybase se pagó a ocho personas en Harvard, tres en Indiana, cinco en Cambridge, cinco en Cambridge y un salario completo o parcial en la Universidad de Nuevo México. Tanto Indiana como Cambridge pudieron obtener el dinero para mantener la parte del programa trabajando el próximo año. La posición de Nuevo México terminó en agosto.

Flybase, que ha estado operando desde 1992, ha recibido apoyo federal durante más de tres décadas. Recopila y resume ensayos de investigación, organiza investigaciones sobre genes específicos y enumera información sobre moscas de frutas genéticamente modificadas para provocar cómo algunos genes guían el desarrollo general.

Las moscas de la fruta incluyen modelos animales importantes para la investigación biomédica porque los científicos pueden mapear sus genomas y cerebros. Son relativamente fáciles y más baratos de hacer frente.

El genoma es profesor y un ávido usuario de la carga de flybase Berg Study Human Development y cómo las células forman órganos. Flybase le permite encontrar e identificar sus genes interesados ​​en los experimentos. Ella examina cómo la expresión de esos genes afecta la alineación de las células.

Cada año, miles de papeles de mosca de frutas se agregan y acortan a la cadena. Sin una cadena de flys, los investigadores y los médicos luchan por seguir adelante y perder contactos importantes sobre genes específicos, dijo Berg.

Los investigadores de enfermedades no diagnosticadas usan una base de flybase de la red, ayudando a identificar si las mutaciones hereditarias en los niños pueden conducir a enfermedades raras e inexplicables. Los científicos identifican mutaciones genéticas en estos pacientes y luego comparan esas variantes con la investigación de esos genes en las moscas.

Flybase ahora tiene soporte de crowdfunding en su sitio web.

«Teniendo en cuenta la importancia de Flybase para la vasta comunidad de investigación científica de los Estados Unidos y la Internacional, esperamos que otras organizaciones y otros internacionales de Harvard apoyen esos esfuerzos», dijo James Chisholm, portavoz de Harvard Art and Science, «muchas secciones de Harvard están trabajando activamente y consumen operaciones adicionales».

Dos empleados basados ​​en Harvard ya han sido despedidos de su trabajo en la cadena de flysbase, y seis están programados para ser despedidos en septiembre y principios de octubre, dijo Periman.

«Si no podemos mantener a un personal líder, es muy difícil volver a las personas que tienen el conocimiento para ejecutar las bases de datos», dijo Periman. «No volverá a Flybase».

Los datos de Flybase interrumpirán los planes para reubicar la nueva casa a largo plazo, la alianza de los recursos del genoma. Las moscas de la fruta tienen muchos «organismos modelo» comunes junto con ratas, ratas y gusanos, que se utilizan en laboratorios y sientan las bases para comprender la biología humana.

El Instituto Nacional de Salud ha gastado más de 5 millones de 2017 para fusionar una serie de datos, incluidos la base de datos de Flybase, Wormbase y Mouse Genome. Todo contiene información que los investigadores de salud humana pueden dar una referencia cruzada al estudio de genes que son importantes para la salud humana.

«Si está estudiando genes humanos y necesita estudiar todo lo que sabe, debe ir a todos estos sitios web)», dijo Paul Sternberg, profesor del Instituto de Tecnología de California, Paul Sternberg, que lidera un esfuerzo de alianza. «Necesitamos dejar de comprar».

El presupuesto de Alliance expira el 30 de junio, y Steerburg dijo que estaba esperando una renovación de dinero de NIH. Dijo que la interrupción del dinero en el flybace representa un obstáculo nuevo e inesperado. Los inventos de investigación son más útiles y más fáciles para fáciles.

«Necesitamos hacer esto más rápido, pero cuando pierde personal y energía, será Daisy», dijo Sternberg. «No arrojes barreras de carretera adicionales. Eso es todo lo que pedimos».

Flybase planeó fusionarse con una alianza en 2029. Ahora, Calvi y otros están presionando por una fusión rápida antes de la pista financiera de Flybase. Las donaciones que la agencia quiere ayudan a pagar por ello.

«Hasta ahora, esto es menos de 000 100,000», dijo los esfuerzos de crowdfunding de Calvi. «Probablemente necesitamos un millón».

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